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5 Novembre 14h00-15h00 |
EnderScope: A Low-Cost 3D Printer Based Microscope for Microplastic Detection Niamh Burke |
As marine microplastic pollution is a global problem, the more measurements we have, the better we can establish a baseline for microplastic pollution, monitor its trends, and implement measures to mitigate it. The EnderScope is a low-cost, easily reproduced microscope for automated scanning and detection of microplastics filtered from seawater samples, which takes advantage of the well-calibrated motion system of a 3D printer for automated scanning over a large area (>20x20 cm). The EnderScope is capable of both reflected light and fluorescence imaging. In both configurations we aimed to make the design as simple and as cost effective as possible, for example, by using low-cost LEDs for illumination and photographic gels as emission filters. We believe this tool is a cost-effective solution for microplastic measurement |
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5 Novembre 15h00-15h30 |
Open Lab Frame, robot 3 axes modulaire pour automatisation de tâches en laboratoire Fabrice Dessolis - Mathias Lechelon Centuri
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La plateforme Multi-Ingénierie CENTURI est spécialisée dans l’appui à la recherche, et propose des services variés dans différents domaines, du hardware au software. Cette présentation détaillera le projet Open Lab Frame, développé au sein de la plateforme. C’est un projet open-source, modulaire, à bas coût et accessible à tous, pour l’automatisation de tâches en laboratoire (prise de photos, vidéos, pipetage, positionnement de boites et couvercles, etc.). La présentation détaillera les points suivants :
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5 Novembre 16h00-16h30 |
Une centrale d'acquisition environnementale avec une arduino MKR, open-source, Robuste et connectée Franck Perret |
L’utilisation de capteurs compatibles Arduino nécessite l’utilisation d’un microcontrôleur afin d’alimenter les différents capteurs, de gérer la fréquence des mesures, d’enregistrer les données et de les transmettre. Dans le cadre de ce développement, nous avons opté pour des cartes microcontrôleur de type Arduino MKR programmables avec l’IDE Arduino : WAN 1310/1300, WIFI 1010, FOX 1200, NARROWBAND 1500, GSM 1400, ZERO. Toutefois ces microcontrôleurs seuls ne permettent de pas de brancher simplement, durablement et efficacement les différents capteurs. Un circuit imprimé été développé avec un soucis de robustesse, de modularité et de faciliter de connexion des capteurs avec le microcontrôleur. Cette carte est le résultat d’un long travail de développement et d’un partage de compétence et d’expériences de différentes équipes. Elle a profité des multiples solutions et innovations apportées aux différents problèmes et disfonctionnements rencontrés lors des phases de terrain, comme sa consommation énergétique, la dérive temporelle des enregistrements, le nombre d’entrée, la fiabilité du RTC (Real Time Clock) et de sa pile bouton ou encore la faible précision des signaux enregistrés. Ces différents développements incluent un faible encombrement, l’utilisation d’un module d’auto-réveil pour limiter la consommation énergétique, d’un RTC intégré afin d’assurer le moins de dérive possible des données ; des entrées analogiques supplémentaires avec une précision de mesure augmentée (module optionnel convertisseur analogue - digital ADS1115), des borniers disposées pour faciliter le branchement de capteurs et le suivi de charge de la batterie. Illustration d’utilisation pour la surveillance des rivières.
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5 Novembre 16h30-17h00 |
Un dispositif de stimulation tactile et de récompense asservis pour l'exploration de l'activité cérébrale chez le rongeur sous microscope 2 photons Jean-Christophe Comte
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L'identification des mécanismes intimes de la mémoire s'appuie sur des approches expérimentales électrophysiologiques et / ou de microscopie multiphotons le plus souvent chez le rongeur (rat/souris) vigile, tête fixe, lors d'une tâche d'apprentissage. Afin de démasquer les processus de mémorisation, il est nécessaire de synchroniser les dispositifs de stimulations et d'enregistrements et asservir la tâche d'apprentissage au comportement de l'animal en lui délivrant une récompense positive ou négative en relation avec la réponse de l'animal à la tâche. Dans un contexte de stimulation tactile des moustaches par des surfaces de granulométrie différentes, le dispositif réalisé pilote 2 servomoteurs, la récompense de l'animal et analyse en ligne de la progression de l'animal dans la tâche. Chaque événements, stimulation, récompense, réponse, sont envoyés depuis le cœur du système (Arduino Uno) vers les entrées d'une carte d'acquisition multivoies. |
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5 Novembre 17h00-17h30 |
EchOpen : Solution d'écographie open-source avec le soutient de l'APHP Mehdi Benchoufi |
EchOpen is an open and collaborative project and community, led by a multidisciplinary core of experts and senior professionals with the aim of designing a functional low-cost (affordable) and open source echo-stethoscope (ultrasound probe) connected to a smartphone, allowing the radical transformation of diagnostic orientation in hospitals, general medicine and medically underserved areas. This initiative is aimed for health professionals from southern and northern countries. |
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6 Novembre 9h00-10h00
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L’importance de l’innovation frugale et de l’open source pour le développement d’une instrumentation scientifique à coût soutenable. François Piuzzi |
L’instrumentation scientifique se caractérise généralement par des coûts élevés, la frugalité et l’aspect open source contribuent à l’obtention d’instruments à des coûts soutenables ainsi qu’à la possibilité de les répliquer sans passer par des brevets. La disponibilité des instruments est indispensable pour le développement scientifique. La créativité est évidemment à la base des différents développements dont nous allons parler. Nous allons présenter les outils et les méthodes qui ont permis les avancées et qui sont indispensables : les leds, les pointeurs lasers, la détection de la lumière avec les détecteurs CMOS (web cam), l’impression 3D, les micro contrôleurs Arduino, les mini ordinateurs Rapsberry Pi (et caméra) et maintenant dans une certaine mesure les smartphones. Détournements et sauts de technologies, récupération de composants (économie circulaire), notion de partage, sérendipité (pas une méthode mais..). Les différents exemples qui seront présentés pour différents domaines scientifiques, donneront une idée de ce qu’il est possible de réaliser. Nous soulignerons l’importance à utiliser ces méthodes pour les pays à faibles revenus (à condition qu’il y ait des formations).
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6 Novembre 10h00-10h30
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Automatisations et améliorations des processus de Bio-Impression 3D Maleaume Soulard |
L’émergence de la Bio-Impression 3D en tant que modèle alternatif à l’expérimentation animale à conduit au développement de bio-imprimantes par les industriels. Sur la plateforme OrgaPrint, localisée sur le campus de l’Université de Poitiers, nous utilisons la bio-imprimante de chez FELIXprinter. Cette imprimante possède un système ouvert, modulable et ne possède pas de logiciel propriétaire pour la gestion du Gcode. Via l’utilisation du logiciel Simplfy3D, nous avons développés différents profils d’impression pour s’adapter aux différentes expériences. Nous avons automatisé la bio-impression dans des plaques 6, 12 et 24 puits. L’amélioration de ces processus permet une production plus rapide des construits limitant également les consommables, mais nécessite un contrôle plus précis de la température au cours du processus au niveau de l’aiguille d’impression. Ces problèmes sont plus particulièrement contraignants lors d’impressions en utilisant les deux extrudeurs car il est indispensable de maintenir l’extrudeur en « pause » à la bonne température. Le développement de ces automatisations nous a conduit à développer un régulateur de température en temps réel pour maintenir la température optimale durant tout le processus. La miniaturisation d’un capteur de température et d’une résistance chauffante au niveau de l’aiguille couplé à un Arduino nous permet de définir une valeur de température et de la stabiliser automatiquement au cours de l’impression. Ceci permet de réduire le temps de préparation et de calibration de la machine avant impression mais également d’homogénéiser les impressions limitant les phénomènes de sur/sous-extrusions. |
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6 Novembre 11h00-11h30 |
Import microscope: empowering smart microscopy with Python Julio Mateo Langerac |
Python-microscope is a free and open-source library designed for high-performance control of microscope devices, such as cameras, stages, and light sources. Built on top of CPython, this library provides a unified interface for controlling even the most complex devices, whether they are connected to the same computer or distributed over a network, thus enabling easy scalability of intricate microscopy setups.
I will also introduce Cockpit, a graphical user interface for microscope control that leverages python-microscope to control devices. Cockpit combines the flexibility of Python with the speed and accuracy of hardware triggers when needed, empowering Python enthusiasts to drive real high-performance smart microscopy.
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6 Novembre 11h30-12h00 |
FOSSbot An open-source and open hardware robot for education Iraklis Varlamis |
FOSSbot is an open source and hardware project initiated by Harokopio University of Athens, Greece, and the Open Technologies Alliance (GFOSS), aiming to provide an affordable and DIY solution for educators who want to teach programming.
The open design of the FOSSbot robot and the modular architecture of the code, allowed the project to evolve and support educators at all levels from the kindergarten to university level and multiple disciplines, from maths and physics to arts.
The 3D designs of the robot are openly available and can be modified or extended to support more functionalities. With a long list of commodity electronics and using a Raspberry Pi zero as its main board, FOSSbot can take various forms and serve in various educational projects.
The main FOSSbot library is in Python and the robot can be programmed using Blockly or Python. An online platform that simulates FOSSbot and provides the same programming interfaces, various activities, and educational material has been recently launched to make it even easier for anyone who is interested in using FOSSbot to have access to its programming environment.
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